制药废水处理是我国亟待解决的问题。我国是一个缺水的国家，人均日用水量仅为世界人均占有量的四分之一。有400多个严重缺水的城市，占全国城市的三分之二。严重的水短缺主要是由于水源和水质造成的。因此，节水、污水净化和中水回用是我国社会主义经济发展的方向。
 
制药废水处理在我国尚未得到有效开发。我国医药工业的发展是不平衡的。企业很多，但是规模很小，生产技术水平也不同。一些公司的生产过程有限，限制了无法回收废水中大量有效成分的能力，增加了废水处理的难度，并限制了废水的再利用，从而浪费了水资源，增加了水的成本和水体污染。
 
制药废水危害主要体现在以下几个方面：
 
1.消耗水体中的溶解氧。制药废水将大量有机物带入天然水中，微生物需要消耗水中大量的溶解氧来降解这些有机物。在此过程中，水体中的耗氧率大于再氧化率，这将导致水中的溶解氧减少。水体中的溶解氧太低将导致其中的好氧生物死亡，这将导致水体发臭并污染水环境。
 
2.破坏水体的生态平衡。药品及其合成中间体，尤其是生物制药过程，将产生大量杀菌和抗菌物质。这些物质在排入水体后会杀死水体中的原始细菌和藻类，严重影响原始生态系统，并影响水体的自净功能。
 
3.对人体健康的危害。制药废水中的某些物质保留在环境中，因为它们无法被天然水体中的微生物降解。低浓度，逐渐富集高浓度。当食物链和食物网进入人体时，对人体健康产生微妙的影响和伤害。
 
随着国家环保意识的不断提高以及各种环境保护政策的逐步实施和完善，制药企业也越来越关注制药废水处理。制药废水处理该技术也在不断地研究和创新，希望制药公司也可以关注清洁生产，并使其更易于处理和回用废水。